Kethoxal - Wikipedia
Kethoxal (3-ethoxy-1,1-dihydroxy-2-butanone) is an organic compound that has antiviral and anaplasmosis properties. [1] [3] It also forms a stable covalent adduct with guanine, which makes it useful for nucleic acid structure determination. [4]
干货分享 | 诺奖表观应用技术之KAS-seq助力转录活性调控研究
Oct 30, 2022 · 最具代表性的反应是一价铜离子催化的叠氮化物-端炔烃环加成反应（CuAAC），由Morten Meldal在2001年发现的，该反应是 叠氮化合物 和炔化合物在加入铜离子后，高效地将两部分以共价的形式结合在一起 [3]。 这种反应现在被广泛用于以一种简单的方式将分子连接在一起，推动化学进入功能化学时代。 2022年10月5日，三位科学家因在“点击化学和生物正交化学” 方面的贡献荣获诺贝尔化学奖。 点击化学和生物正交化学将化学带入功能化学时代，并对生物、 …
Kethoxal | C6H12O4 | CID 34006 - PubChem
Kethoxal is an agent that reacts with guanine to create a covalent adduct. In vivo, Kethoxal reacts with 30S ribosomal subunits yielding inactive ribosomes.
Nature Methods | 何川团队发布新型单链DNA测序方法，可快速、 …
N3-kethoxal分子能够在5分钟内特异性的和活细胞中单链状态的鸟嘌呤反应，被修饰的RNA片段可通过相互作用富集。 值得关注的是， N3-kethoxal修饰是可逆的，加热后即可被去除。
Kethoxal-assisted single-stranded DNA sequencing captures …
Apr 6, 2020 · We recently developed a synthesis for an azide-tagged kethoxal (N 3 -kethoxal), which not only preserves its high reactivity and specificity to guanines in single-stranded nucleic acids, but...
Keth-seq for transcriptome-wide RNA structure mapping
Feb 3, 2020 · RNA secondary structure is critical to RNA regulation and function. We report a new N3-kethoxal reagent that allows fast and reversible labeling of single-stranded guanine bases in live cells.
何川团队开发KAS-seq捕捉全基因组转录和增强子活性动态变化
Apr 7, 2020 · 该工作结合化学生物学和高通量测序手段，开发出基于N3-kethoxal分子的单链DNA测序技术KAS-seq，用于全基因组DNA转录及增强子活性的精准检测。 今年早期，何川课题组报道了N3-kethoxal分子的合成及其在RNA二级结构测定中的应用。
KAS-seq: genome-wide sequencing of single-stranded DNA by N3-kethoxal …
Jan 10, 2022 · We developed N 3 -kethoxal, an azido derivative of kethoxal that reacts with deoxyguanosine bases of ssDNA in live cells within 5–10 min at 37 °C, allowing the capture of dynamic changes....
生物评论周报第115期：新型单链DNA测序方法KAS-seq出炉！
研究人员基于N3-乙氧二羟丁酮和鸟嘌呤在ssDNA中快速而特异性的反应，报道了一种乙氧二羟丁酮辅助的单链DNA测序（KAS-seq）方法。 KAS-seq可快速（在5分钟内）地在全基因组范围内捕获和定位由转录活性RNA聚合酶或其他原位过程产生的ssDNA，所使用的细胞数可低至1000个。 KAS-seq可以定义一组增强子，其为单链，并具有独特的序列基序。 这些增强子与特定的转录因子结合相关，并且比典型的增强子表现出更多的增强子-启动子相互作用。 在抑制蛋白质聚集的 …
N3-kethoxal - APExBIO
N3-kethoxal is a small, membrane-permeable probe, which selectively binds to un-paired guanine residues within a cellular environment and then provides a bio-orthogonal handle for click chemistry reactions.